După confruntarea sa în Infern cu fratele său mai mic Shou, hotărârea lui Shinra Kusakabe de a deveni un erou care salvează vieți de teroarea flăcărilor se întărește. Găsirea unei modalități de a-i transforma pe Infernali înapoi în oameni, dezlegarea misterului Evanghelistului și al Adolla Burst și salvarea mamei sale și a lui Shou - acestea sunt obiectivele pe care Shinra le are în minte. Cu toate acestea, el a ajuns să realizeze că atingerea acestor obiective nu va fi ușoară, mai ales având în vedere pericolul iminent pe care îl reprezintă Evanghelistul. Planul Evanghelistului este clar: să adune cei opt piloni - indivizii care dețin Adolla Burst - și să îi sacrifice pentru a recrea Marele Cataclism de acum 250 de ani. După ce Primul Pilon i-a dezvăluit că se apropie nașterea unui nou pilon, Shinra este hotărât să își protejeze colegii piloni de Evanghelist. Astfel, se declanșează o luptă aprigă între Forța Specială de Foc și Evanghelist. Împreună cu Forța Specială de Foc, lupta lui Shinra continuă, el descoperind adevărul despre Marele Cataclism și natura Adolla Burst, precum și misterele din spatele combustiei umane.